由于肉质的根系，根部腐烂对于十二卷是一种常见的疾病。这种疾病毁坏根系，还能进一步导致茎与叶的腐烂。特别是在高温时它非常致命，可以在数小时内杀死一株植物。

根部腐烂主要是因为植料中过剩的水分造成的。此外，害虫例如蚧壳虫会在根上留下伤口，也可能导致腐烂。推测一株植物有根部腐烂可以从叶子腐烂（通常从外侧开始）、叶子损失（根部不再工作）和当被轻轻提起时，不能稳定地固定在植料中（根部损失）。虽然十二卷会偶尔放弃一些老根，这样的根会变得空心而不是腐烂。

虽然十二卷丢弃一些老根是正常的，大量根部损失是存在问题的表现。这种损失的通常原因是烂根，也可能是介壳虫。

烂根通常是植料中多余水分的结果。采用排水良好的植料以及合适的浇水日程可以解决这个问题。

根粉介壳虫以根系为食。有必要仔细接茬根部，查找它们的痕迹。